光学工程学科于1998年获批建设一级学科硕士点，2011年获批一级学科博士学位授权点，2014年获批博士后科研流动站，近五年共培养近400名硕士研究生。本学科先后于2000年被原信息产业部列为重点学科，2011年入选江苏省首批优势学科并以A等优秀成绩通过验收，且获得二期（2014年）和三期（2018年）连续滚动支持，2022年在全国第五轮学科评估排名B+，所支撑的工程学科进入ESI排名全球前1.67%。

学科带头人黄维院士于2006年在南邮领衔创建了化学学科和材料学科，经过十年艰苦卓绝的建设，两学科全球排名双双进入全球前0.5%，篇均引用次数位列国内前列。2017年获批建设化学和材料科学与工程两个一级学科硕士学位授权点。2022年，材料科学与工程一级学科入选“十四五”江苏省重点学科。